Les données réunies dans la Chronologie jurassienne sont classées dans neuf répertoires offrant autant de clés de recherche. Elles apparaissent toutes chronologiquement dans le répertoire
- Années.
L’accès aux données peut aussi se faire dans les répertoires suivants :
- Lieux pour les renseignements liés à une commune, un hameau, une ferme isolée, un lieu-dit, une rivière ou autre toponyme permettant de localiser un fait. Les données relatives aux anciennes communes fusionnées sont affichées sous l’appellation des anciennes communes
- Personnes pour les renseignements biographiques ou événements impliquant telle ou telle personne
- Alphabet pour le classement thématique des données sous près de 3000 mots-clés: d’«abattoir» ou «absinthe» à «zeppelin» survolant le Jura ou «zones franches».
Cinq répertoires spécifiques concernent des domaines bien documentés:
- Routes
- Chemins de fer
- Histoire
- Problème jurassien
- Sports